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轉染馬上開始了,質粒比例該如何優化?曼小博手把手教你優化質粒比例
發布時間:2025/06/04 點擊數:498

AAV包裝過程中三質粒比例的關鍵策略與常見問題解析

在AAV病毒(du)包(bao)裝(zhuang)的三(san)質(zhi)粒(li)系統中(zhong),質(zhi)粒(li)比(bi)例的優化對病毒(du)滴度、空殼(ke)率和(he)包(bao)裝(zhuang)效率十分重要(yao)。那么(me)在三(san)質(zhi)粒(li)包(bao)裝(zhuang)系統中(zhong),怎么(me)樣才能得(de)到(dao)正確(que)的三(san)質(zhi)粒(li)比(bi)例,達到(dao)理想(xiang)的病毒(du)包(bao)裝(zhuang)效果(guo)呢?很多老師可能都曾(ceng)被(bei)這(zhe)個問(wen)題困擾過(guo),小編現(xian)在就分享(xiang)一些在病毒(du)包裝過(guo)程中(zhong)會(hui)用到的一些小技巧(qiao)。


一、三質粒系統的基本組成與功能

首先,AAV的包裝依賴于以(yi)下三種核心質(zhi)粒(li)的協同(tong)作用:


1、AAV載體質粒(li)

攜(xie)帶目(mu)標基(ji)因(兩(liang)側為ITR序列)及調(diao)控元件,決定病毒基(ji)因組內容

2、輔助質粒(li)(如pHelper)

提供腺病毒輔(fu)助基因(E2A、E4、VA RNA),支持病毒復制與包(bao)裝

3、Rep/Cap質粒

編碼AAV復制(zhi)蛋白(Rep)和(he)衣殼(ke)蛋白(Cap),決定血清型和(he)組織靶向(xiang)性(如(ru)AAV2、AAV9)


二、三質粒比例對病毒包裝的影響

1、推薦比例范(fan)圍

? 經典比例:1:1:1(等摩爾比),但需根據實驗體系調整(方式見下文)

? 優化調整:部分血清型或大片段基因需提高載體質粒比例(如2:1:1),以平衡Cap蛋白與基因組供給


2、比例(li)失(shi)衡的后(hou)果(guo)


三質粒比例失衡的后果


三、確定合適比例的實驗策略

1、梯度實驗(yan)設計

? 比例梯(ti)(ti)度:以1:1:1為(wei)基礎,設(she)置載體(ti)質粒梯(ti)(ti)度(如1.5:1:1、2:1:1)和Rep/Cap梯(ti)(ti)度(如1:1.5:1)

? 固定參數:總質粒量(liang)恒定(如2 μg/孔(kong)于6孔(kong)板),轉染試(shi)劑(PEI)與DNA質量(liang)比(bi)2:1


2、關鍵(jian)檢測指標(biao)

? 病毒滴度(du):通過qPCR、ddPCR(基因(yin)組滴度(du))或其(qi)他方式進行轉染滴度(du)量化

? 空殼率:透射電(dian)鏡(jing)(TEM)或ELISA檢測完整(zheng)病毒顆粒比例

? 細胞(bao)毒性:轉染后48-72小時觀察細胞(bao)形態,CCK-8法測(ce)定存活率


3、血清型特(te)異性優(you)化(hua)


三質粒比例對病毒包裝的影響-血清型特異性優化


4、AAV包裝容量限(xian)制

AAV包(bao)裝容量為4.7kb,若目的基因(yin)(如(ru)大(da)片段基因(yin))接近此閾值,需減少非必需元件(jian)(如(ru)長(chang)polyA尾)以騰出空間。此時(shi)需增加輔助(zhu)質(zhi)粒(Rep/Cap質(zhi)粒) 比例,確保衣殼蛋白充(chong)足支持包(bao)裝。


示(shi)例:包裝4.2kb基因(yin)時,建(jian)議Rep/Cap:載體質粒=2:1;若(ruo)基因(yin)增至4.5kb,可調整為2.5:1。


四、分步優化流程與質量控制

1、預實驗驗證

用熒光報(bao)告(gao)基因(如GFP)替(ti)代目標(biao)基因,快速評估轉染效率(>70%為合(he)格)


2、小規模測試

在6孔板中測(ce)試3-5種(zhong)比例,收集上清檢測(ce)滴度(目標>1×10? vg/mL)


3、放(fang)大生產

選(xuan)擇合(he)適比(bi)例擴大至T75或搖(yao)瓶培養,驗證重復(fu)性


4、質控分析(xi)

SDS-PAGE:檢測衣殼蛋(dan)白完整性(VP1/VP2/VP3比例)

qPCR/ddPCR:確認基(ji)因組包裝效率,排(pai)除ITR序列損傷(shang)


五、常見問題與解決方案

病毒包裝過程中常見問題與解決方案


六、關鍵注意事項與工具推薦

? 質粒質量:質粒純度要足夠高(OD260/280≈1.8-2.0),避免內毒素污染(<0.1 EU/μg)

? 轉染試劑推薦:PEI MAX/GMP級MAXgene

? 血清型推薦(部分)

(1)神經系統:推薦AAV9、PHP.B

(2)肝臟靶向:推薦AAV8

(3)肺部遞送:推薦AAV5或AAV6


七、其它注意事項

? 轉染試劑配比:PEI與質粒質量比建議為 2:1,孵育時間控制在10-20分鐘

? 細胞狀態:使用對數生長期、低代次(≤30代)的293細胞,貼壁系統待匯合度約85%時轉染效果更佳

? 收獲時間:AAV通常在轉染后72小時收毒,此時病毒滴度達到峰值


通過系(xi)統性梯度實(shi)驗、血清(qing)型特異性調整和(he)嚴格(ge)的質控(kong),可(ke)篩選出合適的三質粒系(xi)統比例,有助于提(ti)升AAV包裝效率,降低空殼(ke)率與(yu)細胞(bao)毒性,從而為基因治(zhi)療研(yan)究(jiu)提(ti)供高滴度、高完整性的病毒載(zai)體。


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